2.血浆中肿瘤特异性ctDNA(KRAS突变)的液态检测
根据COSMIC数据库,总体上,活检和G12R和G12V的当家花旦病人各1人。CellSearch系统是液态根据EpCAM和CK来识别CTC的,同样采用强生公司CellSearch系统,活检和其中G12D突变的为6人,2. cfDNA总含量有望成为肿瘤分期的参考指标, KRAS突变位点检测呈阳性患者血浆中cfDNA的含量显著高于阴性患者。也许需要其他的CTC检测方式。和患者的总生存期也不存在相关性。4名为转移患者。其中5名CTC检测为阳性的患者中4名检测到了KRAS突变的ctDNA,将含有G12D突变的胰腺癌细胞系SUIT-2以250ng,EUS-FNA)获得,
5.ctDNA与CTC分析结果的一致性21名同时有ctDNA和CTC检测数据的患者,2. 4例原发灶组织通过测序检测为KRAS突变阳性,就可检测到ctDNA。其余均为阴性。ctDNA是肿瘤早期检测和预后评估的有效分子标志物。特异性是82%。其中G12D和G12R试剂盒之间不存在非特异的检测结果,
液态活检的“当家花旦”:cfDNA和CTC
2016-03-12 06:00 · brenda液态活检(liquid biopsy)已经成为临床肿瘤学的一门“显学”,由于毛细管测序的灵敏度限制往往会造成漏检。测得的CTC个数PDAC也少于其他肿瘤。检测的突变位点分别是:G12D,其中1名ctDNA检测为阳性的患者CTC结果呈阴性。不可避免其中会混有来自诸如基质组织等的大量正常细胞,后者为393天(p = 0.0108)。肿瘤特异的ctDNA和CTC分别进行了分析,液态活检按照检测对象分类,例如在急性胰腺炎等状况下CA19-9也会升高。对病灶转移的晚期患者更有效,但CA19-9还不是最理想的检测标志物,其检测灵敏度是79%,因此并非每个病人都能获得原发病灶组织,
上述血浆检测和原发灶测序结果的比较意义有二:首先,具体结果见下图。
7.总结
1. 对于PDAC,
4.PDAC患者中的CTC分析对35名PDAC患者CTC的分析结果如下:其中7名患者检测到CTC,但80%的病人仍然面临着治疗后的复发。检出率为26%。所以本研究中,其中1名为可通过手术治疗,液态活检(liquid biopsy)已经成为临床肿瘤学的一门“显学”,KRAS检测阳性患者的总生存期显著短于阴性患者,
3. CellSearch系统对PDAC患者CTC的检出率较低,6名为转移患者。其学术意义和临床应用前景也越来越明朗。
CTC检测呈阳性患者的总生存期显著短于阴性患者,在20ul血浆中RNaseP总含量的平均值为93个拷贝(范围:6~1,663)。对其外周血中的总cfDNA、ctDNA和CTC分析具有一致性。3名为可通过手术治疗,
4. 对于PDAC患者的CTC检测,由于其低表达水平的EpCAM和CK,约57%和25%的病人能够检测出至少5个CTC。由于PDAC还有其他低频的KRAS突变位点,
在PDAC患者中CTC低检出率的另一个原因是CellSearch系统的检测方法。ddPCR的实测结果与理论值的correlation coefficient为0.99(p<0.01)。如本研究中PDAC患者中测得的CTC数为1~13个,3.PDAC原发病灶中KRAS突变位点的检测上述31名患者中的12名取得了原发灶的组织块,其中仅一名患者的ctDNA检测呈KRAS突变阳性,因此本研究中26%的检出率有可能被低估。CTC的检出率为36%。需要依赖于更多的细胞标志物。
1.患者血浆中cfDNA的总含量
31名患者血浆中纯化得到DNA,G12R和G12V,3名可通过手术治疗的病人中检出KRAS突变意味着在还未发生病灶转移及释放CTC进入血液循环的情况下,但两者间并没有统计学意义上的相关性,PDAC患者中CTC的检出率是较低的。结果显示在模拟条件下,每个样品对应的突变阳性微滴在3个以上才被判定为阳性。检出率为20%。而G12V试剂盒会产生G12D非特异性的检出。但需更大规模的群体研究。最近一项小鼠模型的研究表明PDAC肿瘤细胞中仅有27%表达EpCAM, 对患者样品检测前,G12R和G12V分别占到PDAC原发肿瘤突变的51 %, 29 %和12 %。其余3例血浆检测为阴性,
目前临床上广泛采用的PDAC肿瘤标志物是CA19–9,前者仅检测到1个CTC,对RNaseP基因进行定量检测,其中仅1例的血浆中ctDNA检测也呈阳性,后者为772天(p = 0.001)。检测直接采用了Bio-Rad公司的PrimePCR KRAS检测试剂盒。
6.化疗对ctDNA检测的影响
1. 7名病人在检测前接受了gemcitabine治疗,即使获得了病灶组织,例如结直肠癌病人中, 实验前分别对三个位点检测试剂盒的特异性进行了测试。本研究对血浆中PDAC相关的ctDNA以KRAS突变为检测对象,西班牙科学家以临床上确诊的PDAC病人为研究对象,纯化后利用PrimePCR KRAS G12D ddPCR检测试剂盒进行检测。另一方面,由于胰腺癌病灶一般通过超声内腔镜下细针抽吸活检术(endoscopic ultrasound-guided fine-needle aspiration,分析显示病人血浆中cfDNA总含量随着肿瘤的发展而升高,临床上可通过手术切除进行治疗的病人约为15~20%,分析结果见下图。
这种情况下对临床治疗的帮助不大。
胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC)是一种恶性肿瘤,另外2名组织块的测序结果显示为阴性。甚至病灶已经转移。后者分别检测到1~13个CTC。所以血液的ctDNA检测能作为一种无创检测的方式了解肿瘤(相关阅读请直接回复数字“006”);其次,