析和连关联中新综述分析方法锁分

近日中国科学院心理健康重点实验室Jurg Ott教授应国际著名杂志《自然综述—遗传学》(Nature Reviews Genetics)的分析法综邀请,曾在Nature和Nature Genetics上发表过18篇论文(包括4篇综述),和关
Nature:连锁分析和关联分析中新方法综述
2011-06-23 13:20 · Chad近日中国科学院心理健康重点实验室Jurg Ott教授应国际著名杂志《自然综述—遗传学》(Nature Reviews Genetics)的析中新方邀请,
生物探索推荐英文摘要
Family-based designs for genome-wide association studies
Abstract:Association mapping has successfully identified common SNPs associated with many diseases. However,连锁联分 the inability of this class of variation to account for most of the supposed heritability has led to a renewed interest in methods — primarily linkage analysis — to detect rare variants. Family designs allow for control of population stratification, investigations of questions such as parent-of-origin effects and other applications that are imperfectly or not readily addressed in case–control association studies. This article guides readers through the interface between linkage and association analysis, reviews the new methodologies and provides useful guidelines for applications. Just as effective SNP-genotyping tools helped to realize the potential of association studies, next-generation sequencing tools will benefit genetic studies by improving the power of family-based approaches.
采用基于家系数据的分析法综实验设计会增强这种连锁分析与关联分析相结合的方法的性能。PNAS,和关包括著名的析中新方传递不平衡(TDT)检验,随后介绍了一些重要的连锁联分基于家系数据的分析方法,这使得研究人员重新对连锁分析方法产生了兴趣,分析法综本文引领读者了解连锁分析与关联分析之间的和关区别与联系,研究等位基因的析中新方父母起源效应问题,其著作Analysis of Human Genetic Linkage 被引用2492次,连锁联分Jurg Ott教授还指出,分析法综并指出了连锁分析和关联分析在遗传学研究中的和关发展方向及趋势。在Science上发表过3篇。并希望通过连锁分析来检测低频率变异。在Lancet,综述了连锁分析和关联分析中的新方法和新应用,撰写了题为“基于家系数据的全基因组关联学习”的综述文章。关联定位分析能够成功地识别与很多疾病相关联的单核苷酸多态性(SNP)位点。然而,另外,家系设计可以控制群体分层,以及连锁分析与关联分析相结合的方法等。连锁分析方法变得尤为重要。以及其他一些在病例-对照关联分析中并没有能够有效解决的问题。
这项工作部分由国家自然科学基金(30730057)资助。Ott 博士和其他研究人员合作,
在新文章中,成为国际公认的连锁分析的代表性著作。JASA等期刊也发表过大量论文。是遗传统计研究的先驱。
Jurt Ott教授的此篇综述文章为揭示复杂疾病的遗传机理研究提供了崭新的视角,该类方法所发现的遗传突变并不能完全解释实际体现出的遗传性,Genome Research,
全基因组关联分析
遗传疾病的连锁分析
目前担任中科院心理研究所客座研究员的Jurg Ott教授是国际知名的资深学者,将对相关领域的研究人员起到重要的指导作用。通常来讲,随着现代全基因组测序技术被应用于小数量样本,将连锁分析与关联分析方法相结合的策略在发现和鉴定完整的疾病相关突变位点的应用中体现最佳的稳健性和统计势。Jurg Ott教授首先简要讨论了连锁分析的基本原理及方法,
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