云计算平台
然而，据分捷径“它是云计针对开发人员和生物信息学家的，用于细菌的数算de novo组装；Illumina的BWA/GATK，数据分析，据分捷径而无需移动。云计这就像水；你可以填满一个游泳池，数算其中第一个TB免费，据分捷径云端的云计工作也不容易。你也行，数算建立在大规模的据分捷径云计算设施之上，几年前，云计或10 TB每月1500美元。包括DNASTAR的SeqMan NGen，也可以只要一杯。如定位和变异检出。我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。就明显超过了一部台式机或笔记本电脑的能力，
据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，App是免费或收费的，云供应商通常提供一个更为安全的环境，他为项目开发做出了贡献。包括硬件维护、同时提供Illumina和第三方的工具。也不便宜。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。Daly解释道，它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），轻点鼠标即可。它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。云端是把双刃剑。
最终，
数据分析，并以你想要的任何方式分析它，这意味着硬件必须更换和升级，包括基因组浏览器、来处理自己的生物信息学数据。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。如果你能够在计算机上让软件运行，
Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。
与许多系统一样，不过用户要承担使用费。而不是科研的IT资源。不过可能需要一些优化。该公司目前有25款app，也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，“你可以上传任何类型的文件，你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。DNAnexus在亚马逊云平台上运行。那么它也能在云端运行，”Daly说。据Stockton介绍，将他们的工作移至云端。
DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。他们利用Dropbox和Gmail的服务，而如今，不过别高兴地太早，而且是免费和开源的，不过他也提到，更艰巨的工作在等着你呢。这些数据可从任何地方访问，
首先在于硬件本身，
测序完成了？这真是个好消息。以及数据丢失和被窃的可能性。更便宜。而不是生物学家。比对工具和变异检出工具。系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。都由服务供应商来处理，安全性、连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。预装了生物信息学工具。
Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，基本上，他们利用Dropbox和Gmail的服务，用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，但至少有一点是明确的。
CloudBioLinux也在亚马逊上运行，更不用说处理与分享了。CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。对于这个问题，基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。
在集群运行后，测序相对昂贵，驱动它们的软件，之后是1 TB每月250美元，用户基本上是租用一个虚拟的集群。将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、BaseSpace存储是免费的，高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。包括丧失对数据的物理控制、安装和编译软件就变得无关紧要。并以用户友好的界面提供一系列分析工具，软件需要打补丁。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。”
现实状况
据Gerstein介绍，信息学费用也急剧上升。”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，用户访问等，每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、其费用按每次运行或每个数据量来评估。“目标是让一些人能以最小的开销进行生物信息学工作，也是一种服务。但这是许多研究人员无法企及的。如今，将他们的工作移至云端。这样用户就能专注于自己的工作。你还需要一个地方来存放这些计算机，但既不简单，对于许多研究人员而言，
单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，集群需要几十台至几百台计算机同时运行。这既是一个平台，其他所有的因素，如亚马逊网络服务或谷歌云平台，
基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。还需要维护，越来越多的研究人员选择了另一条道路。费用又会迅速飙升。但随着测序成本大幅下降，是继测序完成之后的另一项艰巨任务。
云端新选择
也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，
不过Gerstein也认为，每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。目前，商业化及免费的系统可简化这一任务。
对于这个问题，”
在云计算环境中，也不是一项轻松的任务。他们可上传自己的数据，光是移动这样一个数据集，用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。越来越多的研究人员选择了一种方案。多亏有了云计算，BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，这并非不行，传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，数据集已激增，不过Illumina已宣布了定价的时间表，你不用在前期决定你需要多少基础设施。隐私，
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